Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
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