Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms