Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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