Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNGA1P29973 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms