Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNA5P22460 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNA5P22460 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms