Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK11BP21127 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms