Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VEGFAP15692 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms