Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms