Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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