Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI3P10071 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI3P10071 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms