Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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PTPRCP08575 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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