Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAVP06756 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms