Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB4AP04350 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB4AP04350 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms