Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACSL4O60488 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACSL4O60488 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACSL4O60488 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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