Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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