Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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GGTLC3B5MD39 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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GGTLC3B5MD39 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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GGTLC3B5MD39 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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GGTLC3B5MD39 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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GGTLC3B5MD39 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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