Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRD1A4D1F6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms