Protein–RNA interactions for Protein: R4GNA1

MINOS1-NBL1, MICOS complex subunit MIC10 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINOS1-NBL1R4GNA1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MINOS1-NBL1R4GNA1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MINOS1-NBL1R4GNA1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MINOS1-NBL1R4GNA1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MINOS1-NBL1R4GNA1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MINOS1-NBL1R4GNA1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MINOS1-NBL1R4GNA1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MINOS1-NBL1R4GNA1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms