Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX8Q9Y5X2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms