Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HECTD4Q9Y4D8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HECTD4Q9Y4D8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms