Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF330Q9Y3S2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF330Q9Y3S2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF330Q9Y3S2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms