Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDGFL3Q9Y3E1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms