Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YBX2Q9Y2T7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms