Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms