Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFSF13BQ9Y275 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms