Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2BQ9UQN3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms