Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
SMC3Q9UQE7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC3Q9UQE7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms