Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMG5Q9UPR3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms