Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAF8Q9UPN6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF8Q9UPN6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms