Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP18Q9UMW8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
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