Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTC7AQ9ULT0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC7AQ9ULT0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC7AQ9ULT0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms