Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB3Q9ULL4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms