Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN2Q9ULH4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms