Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNH3Q9ULD8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms