Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA3Q9UL41 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PNMA3Q9UL41 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA3Q9UL41 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms