Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJD2Q9UKL4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms