Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms