Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBE1Q9UJT0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBE1Q9UJT0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms