Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP13Q9UII6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP13Q9UII6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP13Q9UII6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP13Q9UII6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP13Q9UII6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP13Q9UII6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP13Q9UII6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP13Q9UII6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP13Q9UII6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP13Q9UII6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP13Q9UII6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP13Q9UII6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms