Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI5

SLC7A8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A8Q9UHI5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC7A8Q9UHI5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC7A8Q9UHI5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A8Q9UHI5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms