Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL3Q9UH77 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL3Q9UH77 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms