Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEPT3Q9UH03 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms