Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBGCP4Q9UGJ1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBGCP4Q9UGJ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms