Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY0

SLC9A2, Sodium/hydrogen exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A2Q9UBY0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A2Q9UBY0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A2Q9UBY0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9A2Q9UBY0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms