Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MBD2Q9UBB5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms