Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC17A7Q9P2U7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC17A7Q9P2U7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms