Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
REREQ9P2R6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
REREQ9P2R6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms