Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD7Q9P2D1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms