Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4Q9P0V3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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