Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKD2L1Q9P0L9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKD2L1Q9P0L9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms